भरतपुर जिले में तीन प्रमुख मौसमी नदियां हैं। बाणगंगा, रूपारेल एवं गंभीर। बाणगंगा जयपुर जिले के रामगढ़ बांध से, गंभीर नदी करौली जिले के पांचना एवं रूपारेल नदी अलवर जिले के जयसमन्द की पहाड़ियों से निकलकर भरतपुर से कामां उपखण्ड में प्रवेश करती है। इसके अलावा करौली जिले के पहाड़ों से निकलने वाली काकुन्द नदी को बारौठा गांव के निकट रोककर बांध बंध बारैठा बनाया गया है जिसका पानी भरतपुर शहर की पेयजल व्यवस्था एवं शेष सिंचाई के काम आता है।